Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NR2E1
|
---|
|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| NR2E1, TLL, TLX, XTLL, nuclear receptor subfamily 2 group E member 1 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 603849 MGI: 1100526 HomoloGene: 37750 GeneCards: NR2E1
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • histone deacetylase binding • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • enzyme binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
|
---|
Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• glial cell migration • cell fate commitment • negative regulation of astrocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of neuron differentiation • somatic stem cell population maintenance • dentate gyrus development • negative regulation of neural precursor cell proliferation • regulation of cellular component organization • extracellular matrix organization • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • behavioral fear response • regulation of timing of neuron differentiation • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • positive regulation of angiogenesis • anterior commissure morphogenesis • regulation of dendrite morphogenesis • positive regulation of neural precursor cell proliferation • multicellular organism development • brain development • positive regulation of cell cycle • amygdala development • retina development in camera-type eye • forebrain generation of neurons • layer formation in cerebral cortex • positive regulation of cell population proliferation • cerebral cortex development • соціальна поведінка • cerebral cortex neuron differentiation • regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • camera-type eye development • olfactory bulb development • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • positive regulation of stem cell proliferation • aggressive behavior • зір • steroid hormone mediated signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • довготривала потенціація
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 6: 108.17 – 108.19 Mb
| Хр. 10: 42.44 – 42.46 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
NR2E1 (англ. Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 385 амінокислот, а молекулярна маса — 42 589[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSKPAGSTSR | | ILDIPCKVCG | | DRSSGKHYGV | | YACDGCSGFF | | KRSIRRNRTY |
VCKSGNQGGC | | PVDKTHRNQC | | RACRLKKCLE | | VNMNKDAVQH | | ERGPRTSTIR |
KQVALYFRGH | | KEENGAAAHF | | PSAALPAPAF | | FTAVTQLEPH | | GLELAAVSTT |
PERQTLVSLA | | QPTPKYPHEV | | NGTPMYLYEV | | ATESVCESAA | | RLLFMSIKWA |
KSVPAFSTLS | | LQDQLMLLED | | AWRELFVLGI | | AQWAIPVDAN | | TLLAVSGMNG |
DNTDSQKLNK | | IISEIQALQE | | VVARFRQLRL | | DATEFACLKC | | IVTFKAVPTH |
SGSELRSFRN | | AAAIAALQDE | | AQLTLNSYIH | | TRYPTQPCRF | | GKLLLLLPAL |
RSISPSTIEE | | VFFKKTIGNV | | PITRLLSDMY | | KSSDI |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|