HMGB2

HMGB2
Ідентифікатори
Символи	HMGB2, HMG2, high mobility group box 2
Зовнішні ІД	OMIM: 163906 MGI: 96157 HomoloGene: 37582 GeneCards: HMGB2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • protein domain specific binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • transcription factor binding; • non-sequence-specific DNA binding, bending; • single-stranded DNA binding; • damaged DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • four-way junction DNA binding; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • RAGE receptor binding; • chemoattractant activity; • double-stranded DNA binding; • DNA binding, bending; • supercoiled DNA binding; • RNA binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • нуклеоплазма; • хромосома; • extracellular region; • ядерце; • perinuclear region of cytoplasm; • condensed chromosome; • клітинне ядро; • міжклітинний простір; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• DNA geometric change; • positive regulation of interferon-beta production; • nucleosome assembly; • DNA recombination; • apoptotic DNA fragmentation; • male gonad development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of endothelial cell proliferation; • positive regulation of erythrocyte differentiation; • inflammatory response to antigenic stimulus; • процес імунної системи; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • response to steroid hormone; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • negative regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • хемотаксис; • response to lipopolysaccharide; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • positive regulation of nuclease activity; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors; • V(D)J-рекомбінація; • Сперматогенез; • positive regulation of innate immune response; • cell chemotaxis; • DNA ligation involved in DNA repair; • spermatid nucleus differentiation; • positive regulation of DNA binding; • вроджений імунітет; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to lipopolysaccharide; • inflammatory response; • positive regulation of megakaryocyte differentiation; • regulation of neurogenesis; • regulation of stem cell proliferation; • DNA topological change; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium; • positive chemotaxis; • ремоделювання хроматину;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3148
	97165
	ENSG00000164104
	ENSMUSG00000054717
	P26583
	P30681
	NM_002129; NM_001130688; NM_001130689
	NM_008252; NM_001363443; NM_001363444; NM_001363445
	NP_001124160; NP_001124161; NP_002120
	NP_032278; NP_001350372; NP_001350373; NP_001350374
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HMGB2 (англ. High mobility group box 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка ст��новить 209 амінокислот, а молекулярна маса — 24 034^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKGDPNKPR	GKMSSYAFFV	QTCREEHKKK	HPDSSVNFAE	FSKKCSERWK
TMSAKEKSKF	EDMAKSDKAR	YDREMKNYVP	PKGDKKGKKK	DPNAPKRPPS
AFFLFCSEHR	PKIKSEHPGL	SIGDTAKKLG	EMWSEQSAKD	KQPYEQKAAK
LKEKYEKDIA	AYRAKGKSEA	GKKGPGRPTG	SKKKNEPEDE	EEEEEEEDED
EEEEDEDEE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь, хемотаксис, рекомбінація ДНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Alexandre S., Li W.W., Lee A.S. (1992). A human HMG2 cDNA with a novel 3'-untranslated region. Nucleic Acids Res. 20: 6413—6413. PMID 1475204 DOI:10.1093/nar/20.23.6413
Shykind B.M., Kim J., Sharp P.A. (1995). Activation of the TFIID-TFIIA complex with HMG-2. Genes Dev. 9: 1354—1365. PMID 7797075 DOI:10.1101/gad.9.11.1354
Fan Z., Beresford P.J., Zhang D., Lieberman J. (2002). HMG2 interacts with the nucleosome assembly protein SET and is a target of the cytotoxic T-lymphocyte protease granzyme A. Mol. Cell. Biol. 22: 2810—2820. PMID 11909973 DOI:10.1128/MCB.22.8.2810-2820.2002
Zimmerman J., Maher L.J. III (2008). Transient HMGB protein interactions with B-DNA duplexes and complexes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 371: 79—84. PMID 18413230 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.04.024
Pusterla T., de Marchis F., Palumbo R., Bianchi M.E. (2009). High mobility group B2 is secreted by myeloid cells and has mitogenic and chemoattractant activities similar to high mobility group B1. Autoimmunity. 42: 308—310. PMID 19811285 DOI:10.1080/08916930902831845

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5000 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P26583 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5000 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P26583 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

HMGB2

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук