Endopeptidase C30
| Peptidase C30, Coronavirus endopeptidase | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikasi | |||||||||
| Simbol | Peptidase_C30 | ||||||||
| Pfam | PF05409 | ||||||||
| InterPro | IPR008740 | ||||||||
| PROSITE | PS51442 | ||||||||
| MEROPS | C30 | ||||||||
| SCOP | d1q2wb1 | ||||||||
| SUPERFAMILY | d1q2wb1 | ||||||||
| |||||||||
| SARS coronavirus main proteinase | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Oktamer proteinase utama SARS. | |||||||||
| Pengidentifikasi | |||||||||
| Nomor EC | 3.4.22.69 | ||||||||
| Basis data | |||||||||
| IntEnz | tinjauan IntEnz | ||||||||
| BRENDA | entri BRENDA | ||||||||
| ExPASy | tinjauan NiceZyme | ||||||||
| KEGG | entri KEGG | ||||||||
| MetaCyc | jalur metabolik | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| Struktur PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| |||||||||
Endopeptidase C30 dalam berbagai coronavirus, sering disebut "3C-like proteinase", merupakan famili enzim yang ditemukan dalam poliprotein Coronavirus dan memotong polyprotein di dua situs pembelahan diri. Endopeptidase C30 adalah sisteina protease di bawah klan PA, klasifikasi MEROPS C30.
Komisi Enzim mencatat keluarga ini sebagai "proteinase utama SARS coronavirus" (Nomor EC: 3.4.22.69). Nama umum "3C" mengacu pada Enterovirus protease 3C.
Fungsi
[sunting | sunting sumber]Enzim ini mengkatalisasi reaksi kimia:[1][2][3]
TSAVLQ-SGFRK-NH2 dan SGVTFQ-!GKFKK adalah dua peptida yang sesuai dengan dua situs pembelahan diri dari proteinase seperti SARS 3C
Enzim ini penting dalam pemrosesan polyprotein SARS coronavirus.
Referensi
[sunting | sunting sumber]- ^ Goetz DH, Choe Y, Hansell E, Chen YT, McDowell M, Jonsson CB, Roush WR, McKerrow J, Craik CS (July 2007). "Substrate specificity profiling and identification of a new class of inhibitor for the major protease of the SARS coronavirus". Biochemistry. 46 (30): 8744–52. doi:10.1021/bi0621415. PMID 17605471.
- ^ Fan K, Wei P, Feng Q, Chen S, Huang C, Ma L, Lai B, Pei J, Liu Y, Chen J, Lai L (January 2004). "Biosynthesis, purification, and substrate specificity of severe acute respiratory syndrome coronavirus 3C-like proteinase". The Journal of Biological Chemistry. 279 (3): 1637–42. doi:10.1074/jbc.m310875200. PMID 14561748.
- ^ Akaji K, Konno H, Onozuka M, Makino A, Saito H, Nosaka K (November 2008). "Evaluation of peptide-aldehyde inhibitors using R188I mutant of SARS 3CL protease as a proteolysis-resistant mutant". Bioorganic & Medicinal Chemistry. 16 (21): 9400–8. doi:10.1016/j.bmc.2008.09.057. PMID 18845442.