Yohan Cauquil ne compte aucune victoire professionnelle. À la suite de l'arrêt du Cycling Club Bourgas (fin 2009), il retourne chez les amateurs en 2010, au Martigues SC en Division nationale 2[2], avec l'ambition de repasser professionnel en 2011[3]. Il termine cette saison à la 21e place du classement de la Fédération française de cyclisme[4].
En 2013, il retourne chez les amateurs, au club de Charvieu-Chavagneux[5]. Après deux saisons dans le club de la régionRhône-Alpes, il se retire des pelotons pour se consacrer à l'entreprise qu'il a créé avec un associé[6].