ADN-T
Ne doit pas être confondu avec ARNt.
L'ADN-T, ou ADN de transfert, est un ADN capable de s'intégrer au génome d'une plante. Lorsqu'une agrobactérie pathogènes des végétaux infecte une plante, elle transfert son ADN-T à ses cellules. L'expression des gènes de l'ADN-T dans les cellules du tissu végétal vont alors provoquer la formation d'une galle ou d'un réseau dense de racines. Agrobacterium tumefaciens et Agrobacterium rhizogenes sont des exemples de bactéries pathogènes des plantes capables de leur transférer leur ADN-T. Ce type d'ADN présente un intérêt majeur dans le domaine de la biotechnologie.
Insertion au génome végétal
[modifier | modifier le code]Dans les agrobactéries, l'ADN-T est contenu dans des plasmides. Il peut s'agir d'un plasmide Ti, comme chez Agrobacterium tumefaciens, ou bien d'un plasmide Ri, comme chez Agrobacterium rhizogenes. Le plasmide Ti et le plasmide Ri contiennent des gènes de virulence codant pour des protéines Vir. Lorsque l'Agrobacterium infecte une blessure chez une plante, la bactérie s'attache à une cellule végétale, puis y injecte son ADN-T associé aux protéines Vir. Les protéines Vir vont guider l'ADN-T jusqu'à l'intérieur du noyau de la plante. L'ADN-T va alors s'intégrer au génome nucléaire de la cellule. Les gènes portés par l'ADN-T sont alors exprimés dans la cellule végétale, modifiant ainsi le comportement de cette cellule. Pour les infections par des bactéries portant le plasmide Ti, cette infection conduit à la formation d'une tumeur (comme la galle du collet)[1]. Pour les infections par les bactéries portant le plasmide Ri, elle conduit à la formation désordonnée de racines[2].
Organisation génique
[modifier | modifier le code]L’ADN-T est un ADN simple brin mesurant 24 kilobases. Il code pour des enzymes permettant la synthèse d’opines et de phytohormones, responsables de la reprogrammation des cellules végétales pour la formation de tumeurs ou de racines. Il est délimité par deux séquences répétées en tandem de 25 bases nucléotidiques, permettant l'initiation et la terminaison de son transfert[3].
Intérêt en biotechnologie
[modifier | modifier le code]La modification génétique de cellules végétales en utilisant l'ADN-T de Agrobacterium tumefaciens est une technique de biotechnologies largement utilisée depuis les années 1980.
Création de plante transgénique
[modifier | modifier le code]Les régions codantes des enzymes contenues dans l’ADN-T peuvent être remplacées par une séquence d’intérêt pouvant être ainsi insérée de manière stable dans le génome végétal. Cette utilisation permet la création de plante transgénique[4],[5].
On peut ainsi introduire au génome d'une plante des gènes d'intérêt ainsi qu'un marqueur de sélection permettant de ne sélectionner que les plantes pour lesquelles la manipulation a fonctionné. Par exemple, introduire un gène de résistance à un herbicide en tant que marqueur de sélection permettra, après avoir inoculé les plantes avec des agrobactéries, de ne sélectionner que les plantes ayant intégré l'ADN-T à leur génome en les exposant au facteur de sélection, ici l'herbicide.
On s'assure ainsi que l'entièreté des plantes sélectionnées présentent les gènes d'intérêt[6]. Certains facteurs peuvent améliorer ou détériorer l'efficacité de la technique, comme le génotype des plantes utilisées, les types et les âges des tissus inoculés, le type de vecteur, les souches d'Agrobacterium utilisées, les gènes marqueurs de sélection et les agents sélectifs, ainsi que diverses conditions de la culture tissulaire[7].
Mutagénèse insertionelle
[modifier | modifier le code]Cette procédure de transfert d'ADN-T peut également être utilisé pour générer des insertions aléatoires dans les génomes végétaux, afin d’obtenir des mutations de gènes, on parle alors de mutagénèse insertionnelle[8]. L'insertion d'une séquence d'ADN-T est en soi une mutation, et son insertion marque le gène affecté, permettant ainsi son isolement en tant que séquence de flanc de l'ADN-T[9].
Utilité en génétique inverse
[modifier | modifier le code]La génétique inverse consiste à tester la fonction présumée d’un gène connu en le perturbant, puis en recherchant l’effet de cette mutation induite sur le phénotype de l’organisme. Le marquage mutagène d'ADN-T permet le criblage des populations par mutations insertionnelles d'ADN-T. Les collections de mutations connues provoqués par l'insertion de l’ADN-T fournissent ainsi des ressources pour étudier les fonctions des gènes individuels. L'utilisation de l'insertion d'ADN-T en génétique inverse a, par exemple, permis d'étudier en profondeur le génome de la plante modèle Arabidopsis thaliana[10],[11].
Notes et références
[modifier | modifier le code]- (en) Ziemienowicz A, « Odyssey of agrobacterium T-DNA », Acta Biochim. Pol., vol. 48, no 3, , p. 623–35 (PMID 11833771)
- (en) Stanton B. Gelvin, « Integration of Agrobacterium T-DNA into the Plant Genome », Annual Review of Genetics, vol. 51, no 1, , p. 195–217 (ISSN 0066-4197 et 1545-2948, DOI 10.1146/annurev-genet-120215-035320, lire en ligne, consulté le )
- (en) J. Gielen, N. Terryn, R. Villarroel et M. Van Montagu, « Complete nucleotide sequence of the T-DNA region of the plant tumour-inducing Agrobacterium tumefaciens Ti plasmid pTiC58 », sur academic.oup.com, (consulté le )
- Zambryski P. et al. 1983. Ti plasmid vector for introduction of DNA into plant cells without alteration of their normal regeneration capacity. EMBO J. 2:2143-2150.
- Heiko Oltmanns, Bronwyn Frame, Lan-Ying Lee et Susan Johnson, « Generation of Backbone-Free, Low Transgene Copy Plants by Launching T-DNA from the Agrobacterium Chromosome1[W][OA] », Plant Physiology, vol. 152, no 3, , p. 1158–1166 (ISSN 0032-0889, PMID 20023148, PMCID 2832237, DOI 10.1104/pp.109.148585, lire en ligne, consulté le )
- Lan-Ying Lee et Stanton B. Gelvin, « T-DNA Binary Vectors and Systems », Plant Physiology, vol. 146, no 2, , p. 325–332 (ISSN 0032-0889, PMID 18250230, PMCID 2245830, DOI 10.1104/pp.107.113001, lire en ligne, consulté le )
- (en) Yukoh Hiei, Toshihiko Komari et Tomoaki Kubo, « Transformation of rice mediated by Agrobacterium tumefaciens », Plant Molecular Biology, vol. 35, no 1, , p. 205–218 (ISSN 1573-5028, DOI 10.1023/A:1005847615493, lire en ligne, consulté le )
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- Anis Ben-Amar, Samia Daldoul, Götz M. Reustle et Gabriele Krczal, « Reverse Genetics and High Throughput Sequencing Methodologies for Plant Functional Genomics », Current Genomics, vol. 17, no 6, , p. 460–475 (ISSN 1389-2029, PMID 28217003, PMCID 5282599, DOI 10.2174/1389202917666160520102827, lire en ligne, consulté le )
- (en) Kenneth A. Feldmann, « T-DNA insertion mutagenesis in Arabidopsis: mutational spectrum », The Plant Journal, vol. 1, no 1, , p. 71–82 (ISSN 1365-313X, DOI 10.1111/j.1365-313X.1991.00071.x, lire en ligne, consulté le )
