Ciudad Malva (Ciudad Violeta en Hispanoamérica por el anime, Violet City en inglés, キキョウシティ Kikyō City en japonés) es una ciudad situada al sur de Johto. En las afueras al este de la ciudad, en el noreste de la ruta 31, se encuentra la Cueva Oscura, y las Ruinas Alfa al suroeste. El líder del Gimnasio Pokémon de Ciudad Malva es Pegaso, que utiliza Pokémon de tipo volador. También hay un chico que ofrece un Onix equipado con bayamarga a cambio de un Bellsprout.
Al norte de la ciudad, se puede encontrar una gran torre, llamada Torre Bellsprout. Está habitada por muchos pensadores, que utilizan Bellsprout y Hoothoot. Luego de derrotar al último pensador, recibirás la MO05/MT70 (Destello). Aquí puedes encontrar Rattata (durante todo el día y noche), y Gastly (solo durante la noche), como Pokémon salvajes.
Las Ruinas Alfa se encuentran al suroeste de Ciudad Malva. Son unas ruinas muy antiguas, supuestamente creadas para los Unowns. En estas, se pueden encontrar varias cuevas, en las cuales se pueden hacer rompecabezas, y una casa, en la cual se encuentran algunos científicos. A veces se encuentran fósiles entre las rocas usando Golpe roca (solo en Pokémon Oro HeartGold y Pokémon Plata SoulSilver).
Esta Academia se encuentra al este de Ciudad Malva. En ella se puede aprender todo lo básico con respecto a los estados de los Pokémon. Al parecer, muchos alumnos concurren en ella.