CCDC151

CCDC151
Identifikatori
Aliasi	ODAD3
Vanjski ID-jevi	OMIM: 615956 MGI: 1924859 HomoloGene: 16533 GeneCards: ODAD3
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 19 (čovjek)
Kraj	11,435,782 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 9 (miš)
Kraj	21,913,930 bp
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine;
Ćelijska komponenta	• citoplazma; • ciliary basal body; • Centriole; • GO:0035085 Aksonema; • projekcija ćelije; • Treplja; • citoskelet;
Biološki proces	• regulation of cilium assembly; • determination of left/right symmetry; • outer dynein arm assembly; • cell projection organization; • axonemal dynein complex assembly; • cilium movement;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	115948
	77609
	ENSG00000198003
	ENSMUSG00000039632
	A5D8V7
	Q8BSN3
	NM_145045; NM_001302453; NM_001302454
	NM_001163787; NM_029939
	NP_001289382; NP_001289383; NP_659482
	NP_001157259; NP_084215
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

Protein 151 domena sa upredenom zavojnicom je protein koji je kod ljudi kodiran genom CCDC151.^[5]

CCDC151 je upredeni aksonemni protein koji osigurava ispravno vezanje spoljašnjih kompleksa dineinskih krakova na mikrotubule, što je potrebno za pravilno ritmiranje cilija

Kloniranje i ekspresija

Pretragom baza podataka za sekvence slične onima u rodu Drosophila Ccdc151, identificiran je mišji i ljudski CCDC151. Ljudski CCDC151 kodira izvedeni protein od 595 aminokiselina sa tri domena sa zavojnicom. U mišjim IMCD3 ćelijama, Ccdc151 je obogaćen na poliovma vretena tokom ćelijske diobe i na baznim tijelima i nepokretnim cilijama nakon diferencijacije. Zebrafish ccdc151 također je lokaliziran na pokretne cilije i bazna tijela.

Pokazano je da se proizvod gena CCDC151 lokalizira na cilijskim aksonemama u ljudskim nosnim respiratornim epitelnim ćelijama. Koristeći analizu reportera, pokazano je da je Ccdc151 eksprimiran u ependimnim ćelijama ventrikulskog sistema u mozgu miša. U mišjim sjemenicima, Ccdc151 je imao snažnu ekspresiju u sjemenskim cjevčicama.

Molekulska genetika

U pet pacijenata iz tri nepovezane porodice s primarnom cilijskom diskinezijom-30 (CILD30), identificirane su dvije različite homozigotne mutacije u genu CCDC151 (E309X) i S419X. Mutacije su pronađene kombiniranim visokopropusnim mapiranjem i sekvenciranjem, kao i analizom veza u jednoj srodničkoj porodici. U ovim porodicama posmatrano je od više od 280 ispitanih CILD osoba, što sugerira da su mutacije CCDC151 rijedak uzrok poremećaja. Pacijentske respiratorne epitelne ćelije pokazale su gubitak proteina CCDC151 i imale su potpuno nepokretne cilije. u usporedbi s kontrolama, u skladu s gubitkom funkcije.

Aksoneme respiratornih cilija imale su nedostatak DNAH5, što ukazuje na gubitak vanjskih krakova dineina, ali normalnu ekspresiju i lokalizacija DNALI1, što ukazuje na to da unutrašnji sklop dinineinskog kraka nije pogođen. CCDC114 i ARMC4 nisu se mogli otkriti u respiratornim epitelnim ćelijamama pacijenata, što sugerira da, za pravilnu aksonemalnu lokalizaciju, ovise o CCDC151. Studije na ćelijama HEK293 i kvascu pokazale su uzajamnu interakciju između divljeg tipa CCDC151 i CCDC114. Nalazi sugeriraju ulogu CCDC151 u sastavljanju vanjskih dineinskih krakova, kao i spajanju vanjskih dineinskih krakova u aksoneme.

Kod dječaka, rođenom u vezi srodnih arapskih roditelja, sa CILD30, identificirana je mutacija E309X u genu CCDC151. Mutacija je pronađena sekvenciranjem cijelog egzomea i odvojena od poremećaja u porodici.

Aminokiselinska sekvenca

10	20	30	40	50
MTSPLCRAAS	ANALPPQDQA	STPSSRVKGR	EASGKPSHLR	GKGTAQAWTP
GRSKGGSFHR	GAGKPSVHSQ	VAELHKKIQL	LEGDRKAFFE	SSQWNIKKNQ
ETISQLRKET	KALELKLLDL	LKGDEKVVQA	VIREWKWEKP	YLKNRTGQAL
EHLDHRLREK	VKQQNALRHQ	VVLRQRRLEE	LQLQHSLRLL	EMAEAQNRHT
EVAKTMRNLE	NRLEKAQMKA	QEAEHITSVY	LQLKAYLMDE	SLNLENRLDS
MEAEVVRTKH	ELEALHVVNQ	EALNARDIAK	NQLQYLEETL	VRERKKRERY
ISECKKRAEE	KKLENERMER	KTHREHLLLQ	SDDTIQDSLH	AKEEELRQRW
SMYQMEVIFG	KVKDATGTDE	THSLVRRFLA	QGDTFAQLET	LKSENEQTLV
RLKQEKQQLQ	RELEDLKYSG	EATLVSQQKL	QAEAQERLKK	EERRHAEAKD
QLERALRAMQ	VAKDSLEHLA	SKLIHITVED	GRFAGKELDP	QADNYVPNLL
GLVEEKLLKL	QAQLQGHDVQ	EMLCHIANRE	FLASLEGRLP	EYNTRIALPL
ATSKDKFFDE	ESEEEDNEVV	TRASLKIRSQ	KLIESHKKHR	RSRRS

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Klinički značaj

Mutacije u CCDC151 povezane su s primarnom diskinezijom cilija.^[6]

Reference

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000198003 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000039632 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Entrez Gene: Coiled-coil domain containing 151".
^ Alsaadi MM, Erzurumluoglu AM, Rodriguez S, Guthrie PA, Gaunt TR, Omar HZ, Mubarak M, Alharbi KK, Al-Rikabi AC, Day IN (decembar 2014). "Nonsense mutation in coiled-coil domain containing 151 gene (CCDC151) causes primary ciliary dyskinesia". Human Mutation. 35 (12): 1446–8. doi:10.1002/humu.22698. PMC 4489323. PMID 25224326.

Dopunska literatura

Jerber J, Baas D, Soulavie F, Chhin B, Cortier E, Vesque C, Thomas J, Durand B (februar 2014). "The coiled-coil domain containing protein CCDC151 is required for the function of IFT-dependent motile cilia in animals". Human Molecular Genetics. 23 (3): 563–77. doi:10.1093/hmg/ddt445. PMID 24067530.

Vanjski linkovi

Lokacija ljudskog genoma CCDC151 i stranica sa detaljima o genu CCDC151 u UCSC Genome Browseru.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000198003 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000039632 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: Coiled-coil domain containing 151".

[6] Alsaadi MM, Erzurumluoglu AM, Rodriguez S, Guthrie PA, Gaunt TR, Omar HZ, Mubarak M, Alharbi KK, Al-Rikabi AC, Day IN (decembar 2014). "Nonsense mutation in coiled-coil domain containing 151 gene (CCDC151) causes primary ciliary dyskinesia". Human Mutation. 35 (12): 1446–8. doi:10.1002/humu.22698. PMC 4489323. PMID 25224326.

[5]